Par le biais du réseau d’échantillonnage des rivières du Québec, le Ministère du Développement durable, de l’Environnement et de la Lutte contre les changements climatiques assure depuis 1979 un suivi périodique de la qualité physico-chimique de l’eau des principales rivières du Québec. Le COBARIC échantillonne, dans le cadre de ce programme, la rivière Noire à Saint-Gilles depuis avril 2016, le Bras Saint-Victor à Beauceville depuis mai 2012 et la rivière Beaurivage à Saint-Étienne-de-Lauzon depuis mars 2013.